此案虽然结束，但所涉官员太多，这批官员被处置后，圣元朝堂出现了极大的空缺。
除此之外，此案造成的后续影响尚未消除，还有很多事情需未善后。
启帝做的第一件事是论功行赏！
“奉天承运，皇帝诏曰，杨道蕴、林怀瑾、凤惊华破案有功，乃社稷重臣，需重重封赏！
杨道蕴由刑部升迁至大理寺，任大理寺卿，官居正三品！
林怀瑾升任御史台，任御史大夫，官居正三品！
钦此！”
杨道蕴和林怀瑾谢恩接旨。
赵跃又拿出另一道圣旨:“陛下有旨，朝堂腐化、奢靡严重，经过此案，朕心甚惊，亦有心肃清朝堂的歪风邪气。
大理寺、御史台皆是被神宗全面渗透的存在，朕特命杨道蕴、林怀瑾明正典刑，填补有志、有才之人，肃清大理寺与御史台之歪风邪气，还朝堂清风雅气朗朗乾坤！”
“臣接旨！”
杨道蕴和林怀瑾接过圣旨，异口同声道:“谨遵陛下圣旨，臣愿为圣元肝脑涂地死而后已！”
启帝十分满意。
除他们二人外，其他有功之臣亦得到晋升。
杨道蕴和林怀瑾与朝中老臣共同挑选了一批有能力、有才干的进士，一大批新鲜血液被注入了圣元朝堂，他们亦得到了重用。
之前被处置的涉案官员，他们空出来的位置很快就被填满。
值得一提的是，这批新鲜血液，都曾深受清王那封绝笔信的影响，他们对圣元心怀热爱，愿意成为清王信中所说的点点星火，他们会匡扶正义、明正典刑！
有他们的加入，想来圣元朝堂很快就能够焕然一新！
启帝并未封赏凤惊华，但凤惊华完全不在意，她很为杨道蕴和林怀瑾高兴。
同时，杨斯年也得到了封赏。
“奉天承运，皇帝诏曰，杨斯年随嘉王攻破天竺，功在社稷，特封为骠骑大将军，加封狼胥侯！”